MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 3475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009928	CAA	2	6	241639	241644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340421
3002	NC_009928	GAA	2	6	241709	241714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340421
3003	NC_009928	GAT	2	6	241719	241724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340421
3004	NC_009928	AAGC	2	8	241869	241876	50 %	0 %	25 %	25 %	158340422
3005	NC_009928	GGA	2	6	241943	241948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340422
3006	NC_009928	CAGCA	2	10	241959	241968	40 %	0 %	20 %	40 %	158340422
3007	NC_009928	AGA	2	6	241984	241989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340422
3008	NC_009928	GATG	2	8	242000	242007	25 %	25 %	50 %	0 %	158340422
3009	NC_009928	CCA	2	6	242011	242016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340422
3010	NC_009928	AGC	2	6	242044	242049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340422
3011	NC_009928	TC	3	6	242080	242085	0 %	50 %	0 %	50 %	158340422
3012	NC_009928	AGC	2	6	242140	242145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340422
3013	NC_009928	AGCT	2	8	242245	242252	25 %	25 %	25 %	25 %	158340422
3014	NC_009928	GAAA	2	8	242762	242769	75 %	0 %	25 %	0 %	158340424
3015	NC_009928	AAGC	2	8	242770	242777	50 %	0 %	25 %	25 %	158340424
3016	NC_009928	TAG	2	6	242801	242806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340424
3017	NC_009928	AAC	2	6	242816	242821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340424
3018	NC_009928	GAA	2	6	242839	242844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340424
3019	NC_009928	GCG	2	6	242972	242977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340424
3020	NC_009928	GGA	2	6	242980	242985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340424
3021	NC_009928	TGG	2	6	243032	243037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340424
3022	NC_009928	CATT	2	8	243108	243115	25 %	50 %	0 %	25 %	158340424
3023	NC_009928	AAG	2	6	243390	243395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340425
3024	NC_009928	TAC	2	6	243404	243409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340425
3025	NC_009928	CTA	2	6	243418	243423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340425
3026	NC_009928	AG	3	6	243510	243515	50 %	0 %	50 %	0 %	158340425
3027	NC_009928	TCT	2	6	243664	243669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340426
3028	NC_009928	TTA	2	6	243688	243693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340426
3029	NC_009928	GAT	2	6	243800	243805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340427
3030	NC_009928	GAA	3	9	243867	243875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340427
3031	NC_009928	GAT	2	6	243926	243931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340427
3032	NC_009928	GTC	2	6	243951	243956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340427
3033	NC_009928	AAG	2	6	244009	244014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340427
3034	NC_009928	GCA	2	6	244015	244020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340427
3035	NC_009928	TGG	2	6	244089	244094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340427
3036	NC_009928	TG	3	6	244151	244156	0 %	50 %	50 %	0 %	158340427
3037	NC_009928	CAT	2	6	244287	244292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340427
3038	NC_009928	TC	5	10	244304	244313	0 %	50 %	0 %	50 %	158340427
3039	NC_009928	CTG	2	6	244395	244400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340427
3040	NC_009928	TTAT	2	8	244424	244431	25 %	75 %	0 %	0 %	158340427
3041	NC_009928	AGA	2	6	244481	244486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340427
3042	NC_009928	CAG	2	6	244518	244523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340427
3043	NC_009928	CAA	2	6	244559	244564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340427
3044	NC_009928	GAA	2	6	244571	244576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340427
3045	NC_009928	ACCC	2	8	244804	244811	25 %	0 %	0 %	75 %	158340428
3046	NC_009928	CCA	2	6	244841	244846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340428
3047	NC_009928	ACG	2	6	245085	245090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340429
3048	NC_009928	TTG	2	6	245142	245147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340429
3049	NC_009928	TGA	2	6	245176	245181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340429
3050	NC_009928	CGC	2	6	245215	245220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340429
3051	NC_009928	GTC	2	6	245228	245233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340429
3052	NC_009928	AGA	2	6	245269	245274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340429
3053	NC_009928	CGA	2	6	245313	245318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340429
3054	NC_009928	GGT	2	6	245393	245398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340429
3055	NC_009928	AAT	2	6	245588	245593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340430
3056	NC_009928	ATG	2	6	245594	245599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340430
3057	NC_009928	A	6	6	245643	245648	100 %	0 %	0 %	0 %	158340430
3058	NC_009928	CT	5	10	245723	245732	0 %	50 %	0 %	50 %	158340430
3059	NC_009928	AT	3	6	245786	245791	50 %	50 %	0 %	0 %	158340430
3060	NC_009928	GCA	2	6	245861	245866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340430
3061	NC_009928	ATC	2	6	246271	246276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340432
3062	NC_009928	CAT	2	6	246294	246299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340432
3063	NC_009928	TCCG	2	8	246368	246375	0 %	25 %	25 %	50 %	158340432
3064	NC_009928	GAC	2	6	246426	246431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340431
3065	NC_009928	GTT	2	6	246542	246547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340431
3066	NC_009928	GAT	2	6	246558	246563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340431
3067	NC_009928	GCTA	2	8	246688	246695	25 %	25 %	25 %	25 %	158340431
3068	NC_009928	AGGT	2	8	246810	246817	25 %	25 %	50 %	0 %	158340433
3069	NC_009928	CTG	2	6	247657	247662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340434
3070	NC_009928	CCAA	2	8	247684	247691	50 %	0 %	0 %	50 %	158340434
3071	NC_009928	GAG	2	6	247816	247821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340434
3072	NC_009928	TAT	2	6	247865	247870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340434
3073	NC_009928	TCC	2	6	247947	247952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340434
3074	NC_009928	ATC	2	6	248032	248037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340435
3075	NC_009928	TC	3	6	248036	248041	0 %	50 %	0 %	50 %	158340435
3076	NC_009928	CAT	2	6	248067	248072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340435
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3079	NC_009928	TGG	3	9	249692	249700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340437
3080	NC_009928	CAG	2	6	249771	249776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340437
3081	NC_009928	TGC	2	6	249809	249814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340437
3082	NC_009928	GATTT	2	10	249817	249826	20 %	60 %	20 %	0 %	158340437
3083	NC_009928	ATGG	2	8	249850	249857	25 %	25 %	50 %	0 %	158340437
3084	NC_009928	CAG	2	6	249871	249876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340437
3085	NC_009928	ATT	2	6	249910	249915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340437
3086	NC_009928	GAT	2	6	250138	250143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340437
3087	NC_009928	CTG	2	6	250162	250167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340437
3088	NC_009928	GTG	2	6	250214	250219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340437
3089	NC_009928	CTG	2	6	250264	250269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340437
3090	NC_009928	TG	3	6	250302	250307	0 %	50 %	50 %	0 %	158340437
3091	NC_009928	CAA	2	6	250309	250314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340437
3092	NC_009928	TGG	2	6	250571	250576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340437
3093	NC_009928	ATG	2	6	250577	250582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340437
3094	NC_009928	CTG	2	6	250600	250605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340437
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3097	NC_009928	TG	3	6	250740	250745	0 %	50 %	50 %	0 %	158340437
3098	NC_009928	CAA	2	6	250747	250752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340437
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3100	NC_009928	TAA	2	6	250860	250865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340437
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3102	NC_009928	TGC	2	6	251085	251090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340438
3103	NC_009928	AGCG	2	8	251129	251136	25 %	0 %	50 %	25 %	158340438
3104	NC_009928	AGA	2	6	251139	251144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340438
3105	NC_009928	ACGC	2	8	251208	251215	25 %	0 %	25 %	50 %	158340438
3106	NC_009928	AATC	2	8	251277	251284	50 %	25 %	0 %	25 %	158340438
3107	NC_009928	CAT	2	6	251376	251381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340438
3108	NC_009928	GAA	2	6	251389	251394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340438
3109	NC_009928	CTCTT	2	10	251410	251419	0 %	60 %	0 %	40 %	158340438
3110	NC_009928	TCC	2	6	251432	251437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340438
3111	NC_009928	TTA	2	6	251439	251444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340438
3112	NC_009928	CAA	2	6	251635	251640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340438
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3114	NC_009928	GTC	2	6	251752	251757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340438
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3116	NC_009928	CTCA	2	8	251908	251915	25 %	25 %	0 %	50 %	158340438
3117	NC_009928	GGC	2	6	252165	252170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340438
3118	NC_009928	CT	3	6	252214	252219	0 %	50 %	0 %	50 %	158340438
3119	NC_009928	AGA	2	6	252279	252284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340438
3120	NC_009928	CAA	2	6	252285	252290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340438
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3122	NC_009928	CCG	2	6	252323	252328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340438
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3238	NC_009928	ATA	2	6	257784	257789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340440
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3240	NC_009928	AATGT	2	10	257941	257950	40 %	40 %	20 %	0 %	158340440
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3243	NC_009928	GGT	2	6	258193	258198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340441
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